Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms