Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms