Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b2Q3UJB0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b2Q3UJB0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms