Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Arfgef3Q3UGY8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arfgef3Q3UGY8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms