Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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