Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem109Q3UBX0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms