Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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