Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q3U595 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U595 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U595 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U595 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U595 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms