Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arid5aQ3U108 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arid5aQ3U108 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms