Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Palb2Q3U0P1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms