Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc9Q3U0M1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms