Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms