Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
InipQ3TXT3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms