Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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