Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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