Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms