Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc13Q3TIR1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc13Q3TIR1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc13Q3TIR1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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