Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prr27Q3SYJ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms