Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl9Q32KG4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms