Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cers3Q1A3B0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cers3Q1A3B0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms