Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd9Q14BI7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms