Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd2Q149F1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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