Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Spatc1Q148B6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms