Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VgfQ0VGU4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms