Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms