Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms