Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms