Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
StumQ0VBF8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
StumQ0VBF8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms