Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms