Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms