Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms