Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms