Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgm3Q08189 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms