Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a2Q07643 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms