Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col17a1Q07563 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms