Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms