Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms