Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fmn1Q05860 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fmn1Q05860 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms