Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms