Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcad1Q04692 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms