Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RelaQ04207 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms