Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnb1Q03717 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms