Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1sQ02789 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms