Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfiaQ02780 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms