Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GscQ02591 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms