Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnnb1Q02248 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms