Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ascl1Q02067 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms