Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms