Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms