Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms